参考答案：

允许日本在中国通商口岸开设工厂。因为它阻碍了中国民族资本主义的发展

解析：《马关条约》规定日本可在通商口岸开设工厂。从此，帝国列强取得了在中国直接投资开办工厂的权利，剥削廉价劳动力和掠夺原材料，严重阻碍了中国民族资本主义的发展。