B

二氧化碳虽然含有碳元素，但属于碳的氧化物，其性质与无机物类似，因此把它看作无机物，故A错；水中含有氢元素和氧元素，所以说水由氢元素和氧元素组成，故B正确；新能源属于污染小，可再生能源，煤属于化石燃料，属于不可再生能源，故C错；为保护水质，要合理的使用化肥和农药，故D错。