参考答案：

本质：参与亲和作用的两个分子（或物质）中，其中之一为蛋白质的情况占绝大多数，或者两者均为蛋白质。一般认为，蛋白质的立体结构中含有某些参与亲和结合的部位，这些结合部位呈凹陷或凸起的结构，能与该蛋白质发生亲和作用的分子恰好可以进入到此凹陷结构中，或者该蛋白质的凸起部位恰好能够进入与其发生亲和作用的分子（一般也是蛋白质）的凹陷部位，就象钥匙和锁孔的关系一样。

影响因素：离子强度、pH、抑制氢键形成的物质、温度、离液离子、螯合剂