BC

A、百米赛跑的速度为9m/s表示一段时间内的速度，为平均速度．故A错误．

B、第3s末是一时刻，该时刻的速度表示瞬时速度．故B正确．

C、子弹出枪口的速度是研究的某一位置的速度，是瞬时速度．故C正确．

D、汽车从甲站行驶到乙站的速度是一段位移内的速度，是平均速度．故D错误．

故选BC．

点评：解决本题的关键会区分平均速度和瞬时速度，瞬时速度表示某一时刻或某一位置的速度，平均速度表示某一段时间或某一段位移内的速度．