参考答案：A, B, D

解析：“地理信息系统”的质量元素包括：①资料质量；②运行环境；③数据质量；④系统结构与功能；⑤系统管理与维护。选项C（逻辑一致性）、选项E（数据格式的正确性），不属于“地理信息系统”的质量元素。