我国南方和北方耕作制度、农作物有明显差异，北方平原广阔，耕地多，但热量较低，降水较少，以旱地为主，主要农作物是小麦；南方多丘陵、山地，但热量高，降水丰沛，以水田为主，主要农作物是水稻．其中，影响南北方耕作制度和农作物差异的主要的原因是气候条件的显著差异．故选项D符合题意．

故选：D．