命题：“∀x∈R，cos2x≤cos²x”的否定为“∃x∈R，cos2x＞cos²x”，故A正确；

∵设x，y∈R，“x＞y＞0”⇒“

x

y

＞1”，反之则不成立，

∴设x，y∈R，那么“x＞y＞0”是“

x

y

＞1”的充分不必要条件．故B正确；

命题“若lgx=0，则x=1”的逆否命题为“若x≠1，则lgx≠0”．故C正确；

若p∧q为假命题，则p，q中至少有一个是假命题，故D不正确．

故选D．