答案：D

题目分析：A、“始祖鸟”是爬行类进化成鸟类的典型证据，B、在人类进化过程中，发生显著变化的是脑容量增加，而直立行走是人类祖先与猿分界的重要标志，C、达尔文提出较为完善的生物进化学说，其核心是自然选择，故A、B、C都不符合题意。

D、化石为生物进化提供了直接的证据，符合题意。

点评：此题为基础题，难度一般，解答此题的关键是熟练掌握生物进化的相关知识。