答案：C

题目分析：A、2molCH₄含有原子的物质的量为2mol×5=10mol；

B、3molNH₃含有原子的物质的量为3mol×4=12mol；

C、4molH₃PO₄含有原子的物质的量为4mol×8=32mol；

D、5molH₂含有原子的物质的量为5mol×2=10mol；

所以3molH₃PO₄含有的原子最多．

故选：C。

点评：考查物质中原子数目计算，难度较小，注意物质中原子数目与物质的物质的量及物质分子含有的原子数目有关。