生物多样性通常有三个层次的含义，即生物种类的多样性、基因（遗传）的多样性和生态系统的多样性．生物种类的多样性是指一定区域内生物钟类（包括动物、植物、微生物）的丰富性，题干中南靖乐土热带原始雨林是80多种鸟类的天堂，生长着1000多种植物，还有各种名贵药材．这体现了生物种类的多样性．
故选：A．