答案：A

题目分析:生物多样性包括；物种多样性；基因多样性和生态系统多样性。物种多样性所呈现出的多种多样的性状是由基因所控制的，所以从根本上说，基因多样性是生物多样性的实质。

考点:本题考查对生物多样性内涵的理解，以及各知识点内在的联系。