植物细胞的结构包括：细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核、液泡和线粒体等结构．

A、细胞壁起保护和支持作用，不含色素，不会成紫色；

B、细胞核里有遗传物质，不含色素，不会成紫色；

C、细胞质的流动可以加速与外界进行物质交换，不含色素，不会成紫色；

D、液泡中含有细胞液，贮存和积累在液泡中的物质包括糖、蛋白质、磷脂、有机酸、植物碱色素和盐类等，所以细胞内大部分呈紫色的是液泡，故正确．

故选：D．