正整数x、y满足方程时，必有x＞y＞0．

∴x+y＞x-y＞0．

又∵x+y与x-y有相同的奇偶性，

∵原方程（x-y）（x+y）=88，右边为偶数，

∴从而x+y与x-y均为偶数，

又∵x+y，x-y是88的因数，

∴有

x-y=2 x+y=44

或

x-y=4 x+y=22

或

x-y=-2 x+y=-44

或

x-y=-4 x+y=-22

或

x-y=44 x+y=2

或

x-y=22 x+y=4

或

x-y=-44 x+y=-2

或

x-y=-22 x+y=-4

，

由此可解得

x=43 y=41

或

x=13 y=9

或

x=-43 y=-41

或

x=-13 y=-9

或

x=23 y=-21

或

x=13 y=-9

或

x=21 y=-23

或

x=-13 y=-17

．

故答案为：

x=43 y=41

或

x=13 y=9

或

x=-43 y=-41

或

x=-13 y=-9

或

x=23 y=-21

或

x=13 y=-9

或

x=21 y=-23

或

x=-13 y=-17

．