2和3是互质数，它们的最小公倍数是它们的乘积：2×3=6，

在1～50这50个自然数中，既能被2整除又能被3整除的数有；6×1=6、6×2=12、6×3=18、6×4=24、6×5=30、6×6=36、6×7=42、6×8=48，

它们的和是：6+12+18+24+30+36+42+48=216；

故选：D．