参考答案：A

解析：

本题考查公积公益金的资本溢价的计算。已知外单位实际投资25000元，但是根据协议投资者的入股额应该占村集体经济组织股份的25%，就是说外单位的投资占25%，村集体经济组织的原有资本占75%，村集体经济组织的原有资本是60000元，那么按照协议的规定，外单位的投资可作为资本入账的金额为60000×（25%/75%）=20000元，25000-20000=5000元。