（1）由题意知三只盒子都不空，且3号球必须在乙盒内，

其余的小球有两种不同的分法，可以分成1，1，1，或者1，2，这两种情况是互斥的，

当三个球在三个盒子中全排列有A₃³=6种结果，

当三个球分成两份，在甲和丙盒子中排列，共有C₃²A₂²=6种结果

∴由分类计数原理知共有6+6=12种结果．

（2）由题意知本题是一个分步计数问题，

∵首先1号球不放在甲盒中，有2种放法，

2号球不在乙盒，有2种结果，

3号球有3种结果

4号球有3种结果，

∴根据分步计数原理知共有2×2×3×3=36种结果，

答：（1）若三只盒子都不空，且3号球必须在乙盒内有12种不同的放法；

（2）若1号球不在甲盒内，2号球不在乙盒内，有36种不同放法．