微生物的发酵在食品的制作中应用十分广泛，制作酸奶要用到乳酸菌．酸奶是以鲜牛奶为原料，加入乳酸菌发酵而成，其原理是在无氧的条件下，乳酸菌发酵产生乳酸，易于消化，所以具有甜酸风味．由题意可知，牛奶是各100mL，甲（500mL）、乙（250mL）、丙（150mL）、丁（100mL）4个锥形瓶中，甲乙丙中会有部分空气，影响乳酸菌的无氧发酵，丁是100mL的瓶子，装入100ml牛奶后能保证无氧的条件，利于乳酸菌发酵产生乳酸，形成酸奶．可见D符合题意．

故选：D