答案：D

A、NaOH是氢氧化钠的化学式，它是由钠离子和氢氧根离子构成的，不能表示物质的一个分子，

B、SiO₂只能表示物质的组成，不能表示物质的一个分子，故错。

C、Fe是铁的化学式，它是由铁原子直接构成的，不能表示物质的一个分子，故选项错误．

D、CO₂是二氧化碳的化学式,能表示一个二氧化碳分子,故正确。

题目分析：

点评：本题难度不大，掌握化学式的含义、常见物质的粒子构成是正确解题的关键。