答案：D

题目分析：构成物质的粒子有分子、原子、离子。分子是指能够独立存在并保持物质化学性质的一种微粒。

A项中NaOH由氢氧根离子和钠离子构成；B项中SiO₂是原子晶体，平均一个硅原子与四个氧原子相连；C项中C由C原子构成；D项中的CO₂是由分子构成的。每个选项都可以表示物质组成，能表示分子的就只有D，故本题选D。

点评：本题考查构成物质的粒子——分子、原子、离子，题目难度不大。