A、台湾岛是我国第一大岛，海南岛是第二大岛．故A错误．

B、2012年6月21日民政部网站21日刊登《民政部关于国务院批准设立地级三沙市的公告》．国务院于近日批准，撤销海南省西沙群岛、南沙群岛、中沙群岛办事处，设立地级三沙市，管辖西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛的岛礁及其海域．三沙市人民政府驻西沙永兴岛．三沙市已经成为地级市，管辖西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛的岛礁及其海域，而黄岩岛属于中沙群岛．故B正确．

C、东海中的岛屿绝大多数是火山岛，棉花屿、钓鱼岛等火山岛沿岸都生长珊瑚礁．故C错误．

D、我国大部分岛屿分布在杭州湾以南的海域，舟山群岛是我国最大的群岛．故D错误．

故选：B．