参考答案：B

解析：

（1）可以扣除的取得土地使用权所支付的金额=1800×1／3=600（万元）；

（2）可以扣除的房地产开发成本=1200×1／3=400（万元）；

（3）可以扣除的房地产开发费用=（600+400）×10%=100（万元）；

（4）可以扣除的相关税金=3000×5%×（1+7%+3%）=165（万元）；

（5）其他扣除项目金额=（600+400）×20%=200（万元）；

（6）可以扣除的项目金额合计=600+400+100+165+200=1465（万元）；

（7）增值额=3000-1465=1535（万元）；

（8）增值率=1535÷1465×100%=104.78%，适用税率50%、速算扣除系数15%；

（9）该企业应纳土地增值税=1535×50%-1465×15%=547.75（万元）。