答案：D

题目分析：显微镜放大倍数等于物镜放大倍数与目镜放大倍数的乘积，所以目镜的放大倍数就应是显微镜放大倍数除以物镜的放大倍数，所以此题中的显微镜的目镜放大倍数为640÷40=16，为16倍。

点评：此题为基础题，较易，解答此题的关键是牢记显微镜放大倍数等于物镜放大倍数与目镜放大倍数的乘积。