A、微生物的发酵在食品的制作中有重要作用，如酿酒、做面包、蒸馒头等离不开酵母菌，酿酒时在无氧的条件下，酵母菌能把葡萄糖分解成酒精和二氧化碳；蒸馒头、做面包时酵母菌分解有机物产生二氧化碳和水，二氧化碳遇热膨胀，使馒头、面包暄软多孔．不符合题意．

B、制酱要用到霉菌，制作腐乳也要用到霉菌，霉菌发酵把有机物分解成氨基酸等物质，利于人体的吸收和提高食品的鲜度，不符合题意．

C、多数细菌对人体是有益的，如制作味精要用到棒状杆菌，制作酸奶和泡菜要用到乳酸菌等细菌．少数细菌对人体是有害的，如有的细菌能够使食物腐败、伤口红肿化脓等．符合题意．

D、细菌细胞无成形的细胞核，真菌细胞有成形的细胞核，二者的主要区别就是有无成形的细胞核，不符合题意．

故选：C