参考答案：B,D

解析： 行政处罚由违法行为发生地的县级以上地方人民政府具有行政处罚权的行政机关管辖。对管辖发生争议的，报请共同的上一级行政机关指定管辖，选项A的说法不是非常准确，不是共同上级机关，而是共同上一级机关指定管辖。根据《行政处罚法》的规定：当事人有下列情形之一的，应当依法从轻或者减轻行政处罚(1)主动消除或者减轻违法行为危害后果的； (2)受他人胁迫有违法行为的；(3)配合行政机关查处违法行为有立功表现的；(4)其他依法从轻或者减轻行政处罚行为的。违法行为轻微并及时纠正，没有造成危害后果的，不予处罚。本案中该运输公司立即采取措施主动消除危害后果，应当从轻或者减轻处罚。司机甲在本案中是执行运输公司的任务，并不是其个人行为，因此应由公司承担责任，故本题答案为BD。