参考答案：A

解析：依据《建设项目竣工环境保护验收管理办法》，建设项目环境保护竣工验收由负责审批该项目环境影响评价文件的环境保护行政主管部门负责。该项目属于应由环保部审批环境影响报告书的范围，故其竣工环境保护验收亦应由环保部负责。