参考答案：D

解析：

操纵子指启动基因、终止基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。操纵子通常由2个以上的编码序列与启动序列、操纵序列以及其他调节序列在基因组中成簇串联组成。启动序列是RNA聚合酶结合并起动转录的特异DNA序列。操纵序列是原核阻遏蛋白的结合位点。也就是说，一个操纵子可以含有多个启动序列和多个编码基因，选项D正确。

选项A、B、C、E均与答案有不符之处，故不正确，故选D。

考点：操纵子的概念