细菌的基本结构有细胞壁、细胞膜、细胞质和DNA集中的区域，没有成形的细胞核，没有叶绿体；真菌的基本结构有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，没有叶绿体；病毒没有细胞结构．

A、①单细胞，有成形的细胞核，有大液泡，是酵母菌单细胞；②没有成形的细胞核，是细菌；③没有细胞结构，是细菌病毒；④单细胞，没有细胞壁、没有叶绿体、没有液泡．是单细胞动物草履虫；⑤细胞内有杯状的叶绿体，是单细胞植物衣藻．故该选项不符合题意；

B、①是酵母菌、②是细菌、⑤是衣藻都有细胞壁，细菌没有成形的细胞核，病毒没有细胞结构，因此有细胞核的是①④⑤．故该选项符合题意；

C、⑤衣藻是绿色植物有叶绿体，③草履虫体内有伸缩泡，③病毒没有细胞结构因此没有细胞膜．故该选项不符合题意；

D、②细菌细胞外有荚膜，有的寄生，有的腐生；③病毒没有细胞结构必须寄生，④草履虫有纤毛可以运动，⑤衣藻和②细菌有鞭毛．故该选项不符合题意．

故选：B．