A、单质是由同种元素组成的，可以由原子构成，也可以由分子构成，如氧气是由氧分子构成的，A错

B、混合物是由多种物质组成的，可能是多种化合物组成，也可能是多种单质构成，也可能是由单质和化合物混合而成，如氢气与二氧化碳的混合物．故B错

C、纯净物可以由同种分子构成，也可以由同种原子构成，如铁是由铁原子构成．故C错

D、化合物是由两种或两种以上的元素组成的纯净物．因此化合物中一定含有不同种元素．故D正确．

故选D