细菌的基本结构为：细胞壁、细胞膜、细胞质、未成形的细胞核；细菌的特殊结构有：鞭毛和荚膜．

所有细菌的基本结构都一样，而特殊结构并不是每个细菌都具备的，故以上四个选项中所有细菌都具备的结构为未成形的细胞核．

故选：D