参考答案：

(1)根据案例材料可知，该公司上述工作程序中涉及如下三项控制活动： 

第一、调节和复核。涉及上述工作程序中第(2)项：出纳人员每天必须根据交款人已签字的收据汇总金额盘点现金，做到账实相符。第(5)项：月度终了，出纳人员及时收集银行对账单，及时核对银行对账单余额与会计记录中的余额，编制银行存款余额调节表，调节表交财务经理审核签字确认。 

调节和复核属于财务报告这一类别。 

第二、实物控制。涉及上述工作程序中第(3)项：出纳人员每天中午前将核对无误的现金存入银行。当天下午收到的现金在下午18:00后进行清点，然后把现金放进保险库。 

实物控制是为了保证资产的安全，因此属于运营这一类别。 

第三、计算和会计。涉及上述工作程序中第(4)项：出纳人员对当天经手的银行存款及现金交易在每天下午18:00后使用会计软件填制凭证，并打印相关凭证记录，核实其相关交易内容。可打印凭证记录均预先连续编号。 

计算和会计属于财务报告的类别。 

(2)针对第(3)项在每天中午前将核对无误的现金存入银行。当天下午收到的现金在下午18:00后进行清点，然后把现金放进保险库。该公司可以采取设立门禁系统、雇佣保安和利用闭路电视摄像头等方式进一步强化。 

(3)针对第(4)项出纳人员对当天经手的银行存款及现金交易在每天下午18:00后使用会计软件填制凭证，并打印相关凭证记录，核实其相关交易内容。该公司应安排不直接经手当天银行存款及现金交易的人执行相关凭证的记录，而不是由出纳人员执行。