参考答案：(1)总体布局结构为“二主三副”不合理(E组团没有成为核心组团的条件)。
(2)没有新增加高速公路出入口3的必要。
(3)城市快速路系统设置不合理。
(4)E组团与A组团之间只有一条城市主干道不合理。
(5)在上风上水方向的C组团安排新型建材、水泥厂选址不当。
(6)污水厂1在水厂3上游选址不当，污水厂数量偏多。