C

题目分析：考查时态。By表示“到…时为止”，要与完成时连用。本题by后面的时间是一个过去时的时间，故使用过去完成时的时态。句意：到妈妈下班回家的时候，我的姐姐和我已经做好了晚饭在等她吃饭了。说明我们做好晚饭是在妈妈下班之前。故C正确。

点评：连词by到…时为止；该词经常与完成时连用，如果后面是现在的时间，句中就使用现在完成时；如果后面是过去的时间，就使用过去完成时；如果后面是将来的时间，就使用将来完成时。