根据自然选择学说可知，害虫和鼠本来就有抗药性和不具抗药性的两种不同的变异类型，随着农药的使用，农药就对抗药性的昆虫和鼠进行了选择，使其保留下来，成为多数，并且抗药性的性状逐代积累、加强．经过检测，在鱼体内也发现了这种农药，是因为农药经雨水冲到河里，通过食物链富集在鱼体内，可见生物圈是一个统一的整体．

   生态系统中的各种生物所占的数量和比例总是维持在相对稳定的状态，这叫生态平衡．如果有一种生物的数量明显减少，生态系统中其他生物就会受到严重的影响．喷洒农药和投放鼠药，虽然杀灭了害虫和鼠，但农药也会杀死一些益虫和其他动物，并且直接或间接以昆虫和鼠为食的动物的数量也会明显减少会灭绝，这势必会影响到生物种类和数量以及基因的多样性．

故答案为：影响该生态系统中的生物种类和数量以及基因的多样性．