参考答案：

（1）微生物和寄生虫卵的污染：蔬菜在栽培过程中施农家肥易被肠道致病菌和寄生虫卵污染，水果在收获、运输和销售过程中可被肠道致病菌和寄生虫卵污染。

（2）农药残留超标：使用过农药的蔬菜和水果，在施药不久即收获销售，常会有一定量的农药残留。

（3）工业废水和生活污水污染：用未处理的污水或废水灌溉菜田，可使蔬菜受到其中有害物质的污染。