某建设单位与A市政公司（简称A公司）签定管涵总承包合同，管涵总长800m，A公司将工程全部分包给B工程公司（简称B公司），并提取了5%的管理费。A公司与B公司签定的分包合同约定：（1）出现争议后通过仲裁解决；（2）B公司在施工工地发生安全事故后，应赔偿A公司合同总价的0.5%作为补偿。 B公司采用放坡开挖基槽再施工管涵的施工方法。施工期间A公司派驻现场安全员发现某段基槽土层松软，有失稳迹象。随即要求B公司在此段基槽及时设置板桩临时支撑，但B公司以工期紧及现有板桩长度短为由，决定在基槽开挖2m深后再设置支撑，且加快基槽开挖施工进度，结果发生基槽局部坍塌，造成一名工人重伤。 建设行政主管部门在检查时，发现B公司安全生产许可证过期，责令其停工。A公司随后向B公司下达了终止分包合同通知书，B公司以合同经双方自愿签定为由诉讼至人民法院，要求A公司继续履行合同或承担违约责任并赔偿经济损失。
发生事故后B公司是否应当支付合同总价的0.5%作为补偿？说明理由。
