参考答案：（1）根据蛋白质等电点的不同来纯化蛋白质；

（2）根据蛋白质分子形状和大小的不同来纯化蛋白质；

（3）根据蛋白质溶解度的不同来纯化蛋白质；

（4）根据蛋白质电离性质的不同来纯化蛋白质；

（5）根据蛋白质功能专一性的不同来纯化蛋白质；

（6）根据蛋白质疏水基团与相应的载体基团结合来纯化蛋白质；

（7）根据蛋白质在溶剂系统中分配的不同来纯化蛋白质；

（8）根据蛋白质选择性吸附性质来纯化蛋白质；

（9）根据蛋白质的某些特殊性质进行纯化。