参考答案：

（1）在制造汽缸过程中，由于回火处理不充分而残存较大的铸造，加工内应力。

（2）在运行中，温度不均匀而产生的温差应力。

（3）汽缸在制造时效处理不足，运行中内应力释放，是引起汽缸法兰变形的主要原因。