A、单质是由一种元素组成的纯净物，分子是由原子构成的，所以单质分子是由同一种元素的原子构成，故A正确；

B、单质分子叙述的是分子要用原子解释，不能直接用元素组成解释，故B错；

C、同一种分子构成纯净物，构成的是一种物质，单质分子说的是分子的构成，应该用原子回答，故C错；

D、单质分子的构成不一定是由两个原子构成，例如臭氧分子是由3个原子构成，故D错．

故选A．