A、含有氧元素的化合物不一定是氧化物，例如硫酸中含有氧元素，但是硫酸不属于氧化物．故选项错误；

B、纯净物不一定由同种分子构成，例如金刚石是由原子构成的物质，氯化钠是由离子构成的物质．故选项错误；

C、含一种元素的物质不一定是单质，例如金刚石和石墨组成的混合物中只有一种元素--碳元素．故选项错误；

D、由同种分子构成的物质一定是纯净物．故选项正确．

故选D．