参考答案：

五军都督府和兵部的关系是：五军都督府负责军队管理，兵部负责军官选授及奉旨调兵。每逢战事，由皇帝授意兵部委派将官担任总兵官，统领卫所军队出征，战后，总兵官归还印信，士兵回归卫所，这种五军都督府和兵部相牵制及兵将分离的政策保证了军权集中于皇帝。