参考答案：

分子标记是通过遗传物质DNA序列的差异来进行标记。

优点：直接以DNA的形式表现，在植物的各个组织、时期均能检测，不存在表达与否的问题；数量极多，遍及整个基因组；多态性高，自然存在着许多等位变异；不影响目标性状的表达；许多分子标记能够鉴别出纯合基因型与杂合基因型。

常见的分子标记种类有RFLP、RAPD、SAP、AFLP、SSCP、SSR、ISSR、MSAP、SCAR、SCOT等。