什么是中度重复序列典型的中度重复序列有哪些
参考答案:在基因组中重复频率10~105的顺序,序列长100~5000 bp,约占基因组的10%~40%。其复性速度快于单拷贝序列,但慢于高度重复序列。少数在基因组中成串排列在一个区域,大多数与单拷贝基因间隔排列。几种典型的中度重复序列包括:(1)A1u家族:Alu序列分散于整个哺乳动物基因组,平均每5 kb就有一个Alu序列。在间隔DNA、内含子中都有Alu序列。Alu序列长度约300 bp,每个序列中有一个限制性内切酶Az“的切点(AG↓CT)而定名为Alu家族。Alu序列具有种的特异性。Alu序列可能参与hnRNA的加工与成熟。(2)Kpn I家族:用限制性内切酶Kpn Ⅰ酶切灵长类动物的DNA,在电泳谱上可看到4个不同长度的片段,即Kpn Ⅰ家族。Kpn Ⅰ家族成员序列比Alu家族长,而且不均一,呈散在分布,属于中度重复序列的长分散片段型。(3)Hinf家族:这一家族以319 bp长度的串联重复存在于人体基因组中。用限制性内切酶Hinf Ⅰ消化人体DNA,可以分离到这一片段。(4)多聚dT-dG家族:多个dT-dG双核苷酸串联在一起,分散于人体基因组。在人基因组中,多聚dT-dG家族序列的平均长度为40 bp。(5)rRNA基因:rRNA基因集中成簇存在,各重复单位中的rRNA基因都相同,如染色体的核仁组织区即为rDNA区。(6)组蛋白基因:组蛋白基因在各种生物体内的拷贝数因种而异。组蛋白基因没有一定的排列方式,在拷贝数大于100的基因组中串联重复形成基因簇。在果蝇和非洲爪蟾中,5种组蛋白组成一个重复单位,也存在间隔区,各种组蛋白基因的转录方向不同。所有组蛋白基因都不含内含子,而且在序列上相应的组蛋白基因都很相似,从而编码的组蛋白在结构和功能上极相似。