欲分离一个已知部分序列的全长基因,通过哪两种技术可以完成如何完成?
参考答案:
可用两种方法:RACE方法和构建cDNA文库。
RACE是一项在已知cDNA序列基础上快速扩增缺失的5’或3’端序列的技术,依赖于RNA连接酶连接和寡聚帽子的快速扩增。
扩增未知片段的操作包括:
(1)获取高质量总RNA;
(2)去磷酸化作用;
(3)去掉mRNA的5’帽子结构,加上特异性RNA寡聚接头并用RNA连接酶相连接;
(4)以特异性寡聚dT为引物,在逆转录酶作用下,逆转录出cDNA第一链,包含寡聚接头的互补序列;
(5)分别以 cDNA第一链为模板进行RACE。3’RACE以5’基因特异序列和3’端寡聚dT下游部分序列为引物进行PCR扩增,获得基因的3’序列。5’RACE以5’端RNA寡聚接头的部分序列和基因特异的3’端反向引物进行PCR,获5’端序列;
(6)将纯化后的PCR产物克隆到载体DNA中,进行序列分析,获5’或3’端序列后,设计全长基因的两侧引物,进行全长基因的扩增,获得全长基因的克隆。
构建cDNA文库包括:
(1)mRNA的制备;
(2)逆转录生成cDNA;
(3)cDNA与噬菌粒载体分子相连;
(4)噬菌粒的包装。
构建高质量cDNA文库后,利用已知部分片段作为探针,对文库进行筛选,可筛出全长基因的克隆。