参考答案：D

解析：

根据岩层形成的规律：覆者新，被覆者老，插足者更新。由图中信息可得知，⑤砂岩覆盖在①火山和⑥石灰岩之上，所以⑥和①形成早于⑤；①火山是在⑥地层之上，所以①火山形成晚于⑤；③岩浆岩岩柱形成时穿透了⑥石灰岩岩层和①火山的岩浆通道，又侵入⑤砂岩岩层，所以③是最晚形成的。所以D正确