A市B区的某税务机关，2007年对辖区内纳税人进行税务检查时发现以下事项：
(1) 发现2007年3月正式成立的A公司 (已办税务登记)，2007年10月检查时，该公司仍未将其财务、会计制度报送税务机关备案。由于拖延的时问较长，于是，主管的税务机关决定对A公司进行罚款处理，决定对该公司罚款20000元。
(2) 发现B公司开具的普通发票填写项目不齐全，于是停止对B公司供应发票。
(3) 发现C公司欠缴税款40万元，税务机关在多次催缴无效的情况下，查封了其一处有产权的不动产，准备以其拍卖所得抵缴税款。C公司闻讯后，以该房产已经抵押给D公司作为合同担保，并且依法办理了抵押物登记手续为由，对税务机关的查封行为提出异议。
(4) 发现E公司欠缴税款30万元，税务机关在多次催缴无效的情况下，对E公司账簿资料进行了检查，发现该公司账户上确实无钱可付，但甲企业应付E公司一笔30万元贷款早已到期，经了解， E公司从未向甲企业追讨过欠款。要求：根据以上情况，回答下列问题：
(1) A公司是否违反了税务管理的规定为什么
(2) 分析税务机关对A公司的罚款决定是否正确为什么
(3) 分析税务机关对B公司停止供应发票的处理是否正确为什么
(4) 分析税务机关如何处理对C公司的税款征收与抵押房产之间的关系。
(5) 分析税务机关可以采取何种措施追缴 E公司欠缴的税款，维护国家税收权益。
参考答案：(1) A公司违反了税务管理的规定。根据规定，从事生产经营的纳税人麻当自领取税务登记证件之日起15日内，将其财务会计制度或财务会计处理办法报送税务机关备案。
(2) 税务机关对A公司的处罚决定不正确。根据规定，纳税人违反税务登记的行为，可以处以2000元以下的罚款，情节严重的，处以2000元以上10000元以下的罚款。而本案中，税务机关的罚款为20000元，超出了规定的标准。
(3) B公司发票填写项目不齐全，属于违反发票管理规定的行为。根据规定，有违反发票管理规定的行为之一的单位和个人，由税务机关责令限期改正，没收非法所得，可以并处1万元以下的罚款。对违反发票管理法规的行政处罚，由县以上税务机关决定；罚款额或没收非法所得款额在1000元以下的，可由税务所自行决定。因此税务机关对甲公司停止供应发票的处理不符合规定。
(4) 首先要看是C公司欠税在前，还是该房产设定抵押在前。如果C公司欠缴的税款发生在房产设定抵押前，则税收应当先于抵押权执行，税务机关有权查封 C公司的房产并以其拍卖所得抵缴税款；如果C公司欠缴的税款发生在财产抵押后，则应保障债权人(D公司)的合法权利，税务机关查封该房产的决定应予以撤销。
(5) 甲企业欠付的货款早已到期，而E公司从未向甲企业追讨过欠款，税务机关可以向法院提出请求，以税务机关的名义代替E公司行使该债权，向甲企业追要这笔货款，以抵偿税款，维护国家税收权益。