参考答案：

解析：总监理工程师工作中的不妥之处 (1) 不妥之处：总监理工程师安排项目监理组负责人分别主持编制A1、A2标段两个监理规划。 正确做法：总监理工程师主持编制A1、A2标段两个监理规划。 (2) 不妥之处：六个职能部门根据A1、A2标段的特点，直接对A1、A2标段的施工单位进行监理。 正确做法：A1和A2两个标段的项目监理组直接对A1、A2标段的施工单位进行监理。 (3) 不妥之处：由相应标段项目监理负责人签发工程暂停令要求停工整改。 正确做法：工程暂停令应由总监理工程师签发。 (4) 不妥之处：总监理工程师主持召开了第一次工地会议。 正确做法：应由建设单位主持召开第一次工地会议。 (5) 不妥之处：第一次工地会议后，总监理工程师对监理规划审核批准后报送建设单位。 正确做法：监理规划应在签订委托监理合同及收到设计文件后开始编制，完成后必须经监理单位技术负责人审核批准，并应在召开第一次工地会议前报送建设单位。