参考答案：E

解析：

Ⅰ不一定真，因为题干中断定的是：崂山牌酸奶中含有的亚1号乳酸被全国十分之九的医院用于治疗先天性消化不良，从中得不出结论：全国有十分之九的医院使用崂山牌酸奶作为药用饮料，因为题干中并没有断定：只有崂山牌酸奶才含有亚1号乳酸。Ⅱ和Ⅲ也都不一定真，因为题干中断定的是：全国十分之九的医院都使用亚1号乳酸治疗先天性消化不良，从中可以推出全国有十分之一的医院或者不治疗先天性消化不良，或者治疗先天性消化不良但不使用亚1号乳酸，而不能推出全国至少有十分之一的医院不治疗先天性消化不良，也不能推出全国只有十分之一的医院不向患有先天性消化不良的患者推荐使用崂山牌峻奶。