参考答案：A, D

解析：

基因突变发生时间：DNA复制时，如有丝分裂间期和减数第一次分裂间期。

A.精原细胞数量的增加通过有丝分裂，形成精细胞通过减数分裂，间期可发生基因突变；正确。

B.初级精母细胞处于减数第一次分裂；错误。

C.次级精母细胞处于减数第二次分裂；错误。

D.根尖分生区细胞成正方形，排列紧密，细胞有丝分裂旺盛，间期可发生基因突变；正确。

选AD。

考点：基因突变发生时间。