参考答案：A

解析：

提高基因突变频率的因素有物理因素，化学因素，生物因素等，A正确；在减数分裂四分体时期，同源染色体上非姐妹染色单体之间发生互换，而a、b属于一条染色体上非等位基因，B错误；b、c基因位置互换，则发生染色体结构变异中的倒位，C错误；任意一个基因发生突变，DNA分子中有基因序列和非基因序列，不一定会影响其他两个基因的表达，D错误。

考点：本题考查基因突变、基因重组、染色体变异等的相关知识，意在考查考生能理解所学知识的要点，把握知识间的内在联系，形成知识的网络结构的能力。