参考答案：D

解析：

有丝分裂后期，着丝点分裂，姐妹染色单体分开成为染色体，染色体数目短暂加倍，所以水稻根尖细胞在有丝分裂后期染色体条数是体细胞的2倍，即48条。故选D

考点：本题考查有丝分裂过程。

点评：本题意在考查考生的识记能力和应用能力，属于容易题。